hydroxidionkilde koncentration og pH Den har en direkte korrelation, hvilket betyder, at højere pH , desto højere hydroxidet koncentration. Ligeledes lavere brintionkoncentration falder. Ved høj pH , så opløsningen er rig på hydroxidioner , og disse negativt ladede ioner kan trække hydrogenioner off af molekyler som basepar i DNA . Denne proces forstyrrer hydrogenbindingen , der holder de to DNA-strenge sammen , får dem til at adskille .
RNA vs DNA
modsætning RNA, DNA mangler en hydroxylgruppe på 2 ' position i hvert sukker gruppe. Denne forskel gør DNA meget mere stabil i basisk opløsning . I RNA, kan hydroxylgruppen i 2'-positionen opgive en hydrogenion til opløsningen ved høj pH-værdi , hvilket skaber en meget reaktive alkoxid -ion , der angriber phosphatgruppen holder to tilstødende nukleotider sammen. DNA ikke lider af denne defekt og dermed nyder bemærkelsesværdig stabilitet ved høj pH .
Alkaline Lysis
Molekylærbiologer ofte gør brug af alkalisk denaturering at isolere plasmid DNA fra bakterier. Plasmider er små løkker af DNA adskilt fra det bakterielle kromosom . I basisk lysis miniprep , biologer tilføje vaskemiddel og natriumhydroxid til bakterier suspenderet i opløsning . Detergentet opløser bakteriecellemembranen mens natriumhydroxid øger pH og gør løsningen stærkt alkalisk . Da de ødelagte celler frigive deres indhold , DNA'et inde deles i sine tråde, eller denaturerer .
Reannealing
Når biologen udtrækker DNA fra cellen , han tilføjer en anden reagens for at returnere opløsningen til en mere neutral pH og udfældning af detergent. Ændringen i pH tillader plasmidet strengene reanneale ; voluminøse kromosom , kan dog ikke gøre det samme , så biologen kan fjerne den sammen med rengøringsmiddel , denaturerede proteiner og andre assorterede junk , forlader plasmid bag . Alkalisk lysis ikke fuldstændigt at rense plasmid-DNA ; snarere , det tjener som et "quick and dirty" måde at udtrække det fra cellen og fjerne de fleste andre forurenende stoffer.
hoteltilbud