Sådan Beregn Sequence Dækning

Berigelse undersøgelser vil kræve en beregning af sekventering data til at bestemme omfanget af dækningen . Dette sker primært med gensekvensering laboratorier , der kræver integreret forberedelse DNA-prøve og præ- berigelse pooling. Beregning sekventering dækning kræver brug variabler, der omfatter den gennemsnitlige sekventering dækning, de samlede målrettede baser og effektiviteten berigelse. Udførelse af denne beregning udføres ved at indtaste alle disse variabler i en ligning . Instruktioner
1

Skriv ud ligningen anvendes til at beregne den gennemsnitlige sekventering dækning. Det vil ligne den ønskede dækning divideret med gennemsnitlig normaliseret dækning. Hvis den ønskede dækning er 10x , og den gennemsnitlige normaliserede dækning er 0,2, så den gennemsnitlige sekventering dækning er 50.
2

Skriv ud ligningen anvendes til at beregne mængden af ​​sekventering. Det vil ligne ( total målrettede baser ) (gennemsnitlig sekventering dækning ) /( berigelse virkningsgrad ) = mængden af ​​sekventering.
3

Stik i 62 MB til "total målrettede baser ", og 0,65 for den " berigelse effektivitet". Tilsæt sekventering dækning beløb på 50x og ligningen vil ligne (62) (50) /0.65 . Resultatet af ligningen vil være 4,8 GB sekventeringsdata .
Hoteltilbud