Sådan Beregn den katalytiske effektivitet

Enzymer er vigtige molekyler - de katalyserer reaktioner , der gør livet ske. Naturen har en bemærkelsesværdig række af enzymer, der katalyserer en bred vifte af reaktioner. Ved sammenligning af disse enzymer , kan det undertiden være nyttigt at betragte dem i form af deres katalytiske effektivitet , også kaldet specificitet konstant , der måler , hvor effektivt enzymet omdanner substratet ( molekylet det virker på ) i produktet. For enzymer , der følger hvad biokemikere kalder Michaelis - Menten kinetik , kan denne konstante nemt beregnes ud fra eksperimentelle data. Instruktioner
1

Skriv ned Km og kcat . Disse konstanter bestemmes eksperimentelt , så bør du allerede har det , før du begynder at forsøge at beregne specificitet konstant.
2

Husk på, at Km betegner ( k- 1 + k2 ) /k1 , hvor k1 er hastighedskonstanten for dannelsen af ​​et enzym -substrat- kompleks , k- 1 er hastighedskonstanten for nedbrydningen af komplekset , og k2 er hastighedskonstanten for dannelsen af ​​produktet fra enzym -substrat- kompleks. En anden (og måske mere oplysende ) måde at definere Km er som den koncentration af substratet , når reaktionen kører på halvdelen af ​​den maksimale hastighed. Hvis et enzym har en stor Km , det tager en masse af substrat at nå enzymets maksimale sats , mens en lille Km betyder kun lidt substrat er nødvendig for at mætte den tilgængelige enzym.
3

Husk på, at kcat er hastighedskonstanten for hastighedsbegrænsende trin i enzym- katalyseret reaktion. Det hastighedsbegrænsende trin er den langsomste trin eller flaskehals, der bestemmer, hvor hurtigt samlet reaktionen kan køre .
4

Divide kcat af Km for at få specificitet konstant. For eksempel, hvis kcat er 600 sekunder ^ -1 og Km er 10 mikromolær , så den katalytiske effektivitet er 60 mikroM ^ -1 s ^ -1.
5

Bemærk at hastigheden af ​​diffusion indstiller en øvre grænse for den maksimale katalytiske effektivitet , som regel i størrelsesordenen 10 ^ 8 til 10 ^ 9 M ^ -1 s ^ -1 . Biokemikere vil undertiden sige, at et enzym, hvis katalytiske effektivitet nærmer sig denne grænse er nået " katalytisk perfektion " .
Hoteltilbud